建立環(huán)境污染菌、供試品檢出菌的微生物數(shù)據(jù)庫，可用于制定潔凈室/區(qū)消毒滅菌程序、供試品檢出菌相關(guān)性分析、污染溯源、以及確定是否重試的重要判定依據(jù)等，對保證產(chǎn)品質(zhì)量和無菌檢查結(jié)果的可靠性具有重要意義。
1、醫(yī)療保健：準確、快速地鑒定細菌、真菌和寄生蟲，以進行正確和及時的疾病診斷，并進行適當(dāng)?shù)闹委煛?/div>
2、流行病學(xué)：為了追蹤病原體和追蹤疾病的傳播和暴發(fā)，以及鑒定新的隔離物，例如抗生素耐藥隔離。
3、制藥工業(yè)：由于微生物是對無菌性的重大威脅，對環(huán)境微生物的準確鑒定通常是制藥行業(yè)良好的生產(chǎn)實踐(GMP)要求。
4、其他用途：包括刑事調(diào)查、微生物取證和環(huán)境研究等。
二、臨床鑒定必須經(jīng)歷的過程：
1、分離培養(yǎng)：臨床細菌學(xué)*的基本技術(shù)，是獲得純培養(yǎng)物的必要手段，即使自動化儀器先進的今天也只能對純菌作出鑒定。
2、細菌的菌落、色素、溶血性、氣味是鑒定的重要特征。
3、形態(tài)學(xué)鑒定：如奴卡菌、紅球菌。
4、動力在各種細菌鑒定：針對形態(tài)不易區(qū)分時來鑒別菌種。
5、氧化酶，觸酶試驗是分別革蘭陰性菌和革蘭陽性菌鑒定試驗。
小結(jié)：傳統(tǒng)的鑒定方法通過優(yōu)選實驗項目，同一科內(nèi)的不同屬、種可以選擇不同的鑒定指標。
三、傳統(tǒng)方法微生物鑒定方法的不足之處：
1、手工操作比較繁瑣對技術(shù)人員要求較高。
2、耗時長，鑒定時間至少需要18-24小時。
3、針對疑難菌、少見菌、苛養(yǎng)菌鑒定比較薄弱。
4、成本高：主要集中在各種試劑。
